计算机科学与工程学院 (原资讯科技学院) 创建于2000年，是大学最早的四个学院之一，拥有从学士、硕士到博士的完整人才培养体系。目前理学学士学位课程设有：计算机科学、电子与信息工程和软件工程三个专业；理学硕士 (资讯科技) 学位课程设有：计算机与资讯系统、通讯工程和太空资讯技术三个专业，以及应用数学与数据科学硕士课程；而理学博士学位课程设有：计算机技术及其应用、电子资讯科技和太空资讯技术三个专业，先进网络博士学位课程，以及人工智能博士学位课程。历年来，学院已培养了近1339名理学学士，425名理学硕士，以及123名理学博士。
2021年，澳门科技大学的计算机科学专业，在泰晤士高等教育 (times higher education) 发布的2022年世界大学学科排行榜中，位列世界101-125区间；以及在上海软科于2021年发布2021「软科世界一流学科排名」(shanghairanking’s global ranking of academic subjects) 中，位列世界151-200区间，此次排名的对象为全球500 余所大学。
近年来，学院的研究取得长足进步。2019-2020学年，学院的研究经费为七千五百万澳门元 (69个项目)， 经费来源包括： 澳门特别行政区科学技术发展基金、国家自然科学基金、澳门高等教育基金等。 科睿唯安 (原汤森路透) 于2021年7月发布的「基本科学指标资料库」(essential science indicators，简称esi) 统计数据显示，澳门科技大学的计算机科学首次进入相关学科领域全球高校及科研机构排名前1%。学院的科研成果为此做出了重要贡献。为了进一步推动研究项目的开展，学院还申请获得七百多万澳门元的经费，并于2019年建立了澳门最先进的gpu族服务器。